后勤的影响本就是要大於兵力，更別提上杉家还分出了相当一部分粮食用於接济给丹波、山城两国的饥民、流民。
再加上，若是清定选择挟大胜之余威攻入摄津、河內、和泉等国，那么此时掌控三好家大权的三好长逸、三好笑岩、岩成友通等人极有可能会主动放弃摄津、河內、和泉等地，將残余的军势撤回淡路、讃岐、阿波等国之中，与留守军势合流后，形成新的重兵集团，从而在未来近畿诸国的战场上对上杉家造成极为不利的態势。
而且，官军的补给线被拉得太长，且位於中山道的陆路补给线几乎就在六角家、仁木家的眼皮子底下，他们完全可以频繁对官军的小荷驮队进行袭扰，其后果是极为严重的。
若不是先前上杉定虎於长光寺城外一举重创了六角家、仁木家两家的有生力量，否则官军真的会陷入进退失据、左支右絀的狼狈境地。
“是臣愚钝，未考虑周祥。”穴泽氏清毕竟是上条播磨守家的足轻出身，眼界自然有著一定的局限性，並没有看得太远。
“罢了，罢了。余只是想在率官军主力离开雍州之前提醒一下你们，不要与偽朝余孽正面交锋，视形势可以让出两京之地，只需確保雍州邻近丹州、江州两州的重镇要地即可。”清定可没有怪罪穴泽氏清的意思。
“臣遵命！”八条定繁、穴泽氏清也不再提出异议。
由於京都在遭到多次兵燹，几乎成为一片焦土，就连禁里御所也只剩下清凉殿、仁寿殿、宜阳殿、常寧殿、贞观殿等寥寥数座宫殿倖免於难。至于禁里御所外围的宫门、花舍、马厩等更是尽数被毁。
就算官军压制了丹波、山城两国全境后，曾对禁里御所南面的建礼门、承明门、永安门、长乐门进行修缮，也只是勉强让这些宫门恢復了防盗功能罢了，根本不能承受攻城器械的攻击。
为此，清定在上奏正亲町天皇迁都之前，就命留守在小田原城的上杉定虎、新发田纲贞、仓贺野尚行、新津胜邦、栗林赖忠等人负责对江户城进行大规模的普请，意图將江户城营建成一座新的都城。
为了能留给世人一种大气、热闹、豪华、规模巨大的印象，清定更是许可上杉定虎、新发田纲贞、仓贺野尚行、新津胜邦、栗林赖忠等人召集武藏、相模、伊豆、下总、下野、上野、越后、岩代、磐城、羽前、陆前、信浓、甲斐、骏河等国大量的锯木匠、屋顶匠、铁匠、榻榻米匠等，为他们签发朱印状，免除了他们所在领国的栋別钱、段钱、夫钱（代替夫役所缴纳的铜钱或大米）等各种杂税，让他们来承担江户城的扩建和改修。
本丸的天守阁建七层——第一层为石墙，作为仓库放置粮草；石墙之上建第二层，墙壁贴金，柱数二百零四根，绘百鸟及儒者；第三层，柱数一百四十六根，绘花鸟及贤人像；第四层，柱数九十三根，绘松、竹等；第五层，无绘，为三角形；第六层，八角形，经清定亲自设计，外面的柱漆红，里面的柱则包金箔，周围有雕栏，刻龟和飞龙，外壁绘画恶鬼，內画释迦牟尼与十大弟子说法图；第七层，室內外皆涂金箔，四柱雕龙。