出於迅速稳定摄津一国形势的考虑，清定便留用松田守兴、福家长显等人，让他们作为自己的直臣，去协助上杉家对摄津、山城、河內、和泉等新兼併的领国进行检地。
对於先前负隅顽抗，且不识时务的能势赖幸、能势赖时（能势赖幸之弟）、盐川政年、中川重清、高山重利等在越水城被俘的部分摄津国人领主们，清定不再心慈手软，反而是下令將他们尽数押往京都六条河畔斩首示眾，这些人的家眷也分別流放至津轻外浜郡、田舍郡、山边郡、平贺郡等地，充实当地人口。
至此，摄津一国得以静謐。
在见识过葡萄牙卡拉克战船的威力后，清定顿时心生利用以扎比.布莱克索恩为首的扎比教与天主教会抗衡的想法。
而且，连一向宗开山祖师亲鸞上人，以及前任一向宗法主本愿寺证如都倡导一向宗信徒应以『王法（天皇、將军施政的政治）为本』，凭什么天主教会就能凌驾於法度之上肆意妄为
隨著越水城陷落，以及三好熊王丸、细川氏纲、三好长逸等人授首后，清定便开始对摄津一国进行相关的人事安排，以巩固上杉家的战果。
鑑於摄津一国地理位置非常重要，且与三好家治下的淡路、阿波、讃岐等国仅有一海之隔，清定並不打算过多倚靠那些新降服於上杉家军门之下的国人领主：
三好政胜受封摄津东成郡榎並城，领有一万七千石知行地，並担任东成郡郡司、西成郡郡司、大坂城城代等职；
香西元成受封摄津岛下郡茨木城，领有一万五千石知行地，並担任岛下郡郡司；
井上正季受封摄津能势郡丸山城，领有一万石知行地，並担任能势郡郡代；
木泽相政受封摄津川边郡一藏城，领有一万石知行地，並担任川边郡郡司；
芥川孙十郎受封摄津八部郡瀧山城，领有一万三千石知行地，並担任八部郡郡司；
有马城城主有马重则所领半减，仅领有五千石知行地，且不再担任有马郡郡司；
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户崎城城主浦野重次从常陆新治郡转封至摄津有马郡稻田城，领有两万五千石知行地，並担任有马郡郡司；
一条寺城城主八条定繁加封摄津岛上郡高槻城一万五千石知行地，併兼任芥川山城城代，山城守护代兼京都所司代、爱宕郡郡司、葛野郡郡司、宇治郡郡司、纪伊郡郡司等职如故；