原本还在围攻中村御所的安宗实刻、小岛政章、二宫惟宗、漥川俊光、志和宗茂、广井俊国、中脇美作守、依冈左京进、加久见左卫门、大歧左京进、大冢八木右卫门等人见势不妙后，当即率本部军势撤回了本领，生怕遭到两面夹击。
由於土佐国司一条家家老眾在与土佐国司一条家旗下国人领主们的交锋中遭到重创，只能眼睁睁看著长宗我部军接管中村御所，並將现任土佐国司一条家家督一条內政护送至长宗我部领腹地的南长冈郡大津城。
而后，长宗我部元亲还將自己的嫡女长宗我部菜菜嫁给一条內政作为正室，向土佐国司一条家眾人表示自己愿意与土佐国司一条家和睦共处之意。
就这样，漥川俊光、志和宗茂、广井俊国、中脇美作守等原土佐国司一条家旗下国人领主们先后臣从於长宗我部家的军门之下，並向其递交人质、誓书。
至此，雄踞西土佐半国之地的土佐国司一条家在实际上灭亡了。
而安宗实刻、小岛政章、二宫惟宗、依冈左京进、加久见左卫门、大歧左京进、大冢八木右卫门等少数土佐国司一条家旗下国人领主们却並没有与他们的同僚那样选择追隨长宗我部家，碍於实力不济，並不能与长宗我部家进行公开抗衡，就只能积极派遣使者与雄踞北九州的大友家取得联繫，希望大友家能儘快发兵扶持一条兼定重返土佐、恢復旧领，进而將长宗我部家的势力逐出幡多郡、高冈郡两郡。
然而，此时的大友家可没有余力来理会土佐国司一条家旧臣们的请求。
因为，大友宗麟正被高桥鉴种、秋月种实、筑紫广门等人的兴兵作乱弄得是焦头烂额。加上肥前境內的龙造寺家正在不断扩张势力，大有一统肥前的跡象。
与此同时，弘中方明、冷泉元丰、小原隆言、蒞户政乔、平冈重政、小仓家房等镇守於山的上杉家家臣们却將一则重磅消息传至京都清水寺——徽王王直於永禄元年（明嘉靖三十七年）二月在浙江杭州西湖被巡按御史王本固诱捕。
不单单是王直被擒下狱，就连胡宗宪麾下的市舶使提举蒋洲也被浙江巡抚周斯顺以勾结倭寇的罪名下狱。
別看蒋洲与王直一同离开肥前平户，可他们並不在一条船上，导致他们在前往浙江的途中遭遇颱风后失散。
蒋洲素来清正廉洁，又不是严嵩、严世蕃父子的门生故吏，自然没有金银財宝、海外珍奇。导致严嵩、严世蕃父子一派皆以为蒋洲出使扶桑数年之久，囊中必厚。
儘管王直被捕入狱，还是在狱中写下了《自明书》来表明心跡：“窃臣（王）直觅利商海，卖货浙（江）、福（建），与人同利，为国捍边，绝无勾引党贼侵扰事，情，此天地神人所共知者。夫何屡立微功，蒙蔽不能上达，反罹籍没家產，臣心实有不甘。扶桑虽统於一君，近来君弱臣强，不过徒存名號而已。其国尚有六十六国，互相雄长。如皇上仁慈恩宥，赦臣之罪，得效犬马微劳驰驱，浙江定海外长涂等港，仍如广中事例，通关纳税，又使不失贡期。效犬马微劳驰驱，愿为朝廷平定海疆”
至於招降王直的胡宗宪自然不愿前功尽弃，便屡屡上奏朝廷为王直、叶宗满、蒋洲等人求情。
可是，明世宗朱厚熜依旧下旨处斩王直，並下令俞大猷、戚继光等人发兵攻打停泊於舟山群岛的王直所部倭寇、大友家和松浦家使团。
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